APF Valtellina nasce dall’unione, iniziale, di due Centri di Formazione Professionale regionali (ex CFP Sondrio e CFPA Vallesana), creati in seguito all’entrata in vigore della Legge di riforma sulla Formazione del 1980 (legge regionale n. 95/1980) e trasferiti alla Provincia di Sondrio, all'interno del quadro normativo relativo al Progetto di Riorganizzazione del Sistema delle Autonomie Locali, attivato dall'anno 2000.

In conseguenza di tale trasferimento, la Provincia di Sondrio, nell'anno 2006, ha costituito l'Azienda Speciale per la Formazione, dando vita a un soggetto “...strumentale dell’Ente Locale, dotato di personalità giuridica, di autonomia imprenditoriale e di un proprio Statuto...” (art. 114 del Decreto Legislativo n. 267/2000), che attualmente si occupa “...della gestione dei servizi formativi e delle attività tese alla promozione della cultura formativa nell’ambito professionale...”.